Muzeum prowadzi swoją działalność od 21 czerwca 1971, choć próby jego utworzenia były podejmowane w latach 20. i 30. XX wieku.

W Akwarium Gdyńskim prezentowane są wystawy muzealne dotyczące oceanografii, hydrobiologii oraz akwaria z florą i fauną zarówno morską, jak i słodkowodną.

Łącznie 215 gatunków z 61 rodzin, w tym:
142 gatunki ryb,
3 gatunki płazów,
12 gatunków gadów,
58 gatunków bezkręgowców.